MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus agalactiae SA20-06 chromosome

Total Repeats: 7593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019048	TTG	2	6	8	13	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019048	TTC	2	6	20	25	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019048	T	7	7	46	52	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019048	AAT	2	6	68	73	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019048	GAA	2	6	92	97	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019048	CTA	2	6	1573	1578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019048	TAC	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_019048	AT	3	6	1599	1604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019048	ATG	2	6	2811	2816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019048	TA	4	8	2830	2837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019048	TAA	2	6	2858	2863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019048	TTG	2	6	2878	2883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019048	ACAGA	2	10	2931	2940	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_019048	GAT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019048	A	9	9	2950	2958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019048	AAAG	2	8	2986	2993	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019048	ATC	2	6	2996	3001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_019048	AGG	2	6	3012	3017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019048	TTA	2	6	3072	3077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019048	CAGA	2	8	3151	3158	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019048	TTTA	2	8	3181	3188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019048	TAAAA	2	10	3261	3270	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019048	A	6	6	3267	3272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019048	ATT	2	6	3330	3335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019048	TTC	2	6	3339	3344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_019048	GACAG	2	10	3372	3381	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_019048	T	6	6	3405	3410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019048	TAT	2	6	3535	3540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019048	TAC	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_019048	TTGA	2	8	3627	3634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019048	A	6	6	3682	3687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019048	TA	3	6	3694	3699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019048	AAT	2	6	3927	3932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019048	AAT	2	6	3964	3969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019048	AGA	2	6	4014	4019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019048	GTT	2	6	4056	4061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019048	A	7	7	4175	4181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019048	ATA	2	6	4199	4204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019048	ATT	2	6	4231	4236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019048	CTA	2	6	4243	4248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_019048	TCT	2	6	4362	4367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019048	TCT	2	6	4383	4388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019048	T	6	6	4390	4395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019048	ATA	2	6	4399	4404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019048	TTGA	2	8	4408	4415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019048	TAA	2	6	5554	5559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019048	TTA	2	6	5596	5601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019048	GA	3	6	9863	9868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019048	AG	3	6	9873	9878	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019048	CT	3	6	9886	9891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_019048	A	9	9	9938	9946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019048	TAG	2	6	9955	9960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019048	TAGA	2	8	9969	9976	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019048	ATC	2	6	9985	9990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019048	A	6	6	13869	13874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019048	CT	3	6	13879	13884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_019048	TCA	2	6	15863	15868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019048	ATGAAG	2	12	15938	15949	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019048	AAG	2	6	15966	15971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019048	GTTA	2	8	16027	16034	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019048	ATA	2	6	16041	16046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019048	A	6	6	16068	16073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019048	GA	3	6	16131	16136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019048	TAG	2	6	16145	16150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019048	AAC	2	6	16160	16165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_019048	A	7	7	16169	16175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019048	AG	3	6	16224	16229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019048	ACGA	2	8	16256	16263	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_019048	A	6	6	16303	16308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_019048	GGC	2	6	16389	16394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_019048	TGA	2	6	16445	16450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019048	GTTA	2	8	16548	16555	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019048	CGA	2	6	16634	16639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019048	GCA	2	6	16708	16713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_019048	CGC	2	6	16755	16760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_019048	GTGA	2	8	16761	16768	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019048	TGT	2	6	16794	16799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019048	AGA	2	6	16803	16808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019048	TAAC	2	8	16844	16851	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_019048	CAG	2	6	16877	16882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_019048	AGCG	2	8	16932	16939	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_019048	GGA	2	6	17002	17007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019048	AT	3	6	17061	17066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019048	GGA	2	6	17067	17072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019048	CT	3	6	17092	17097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_019048	GAA	2	6	17331	17336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_019048	GGT	2	6	17405	17410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_019048	GTC	2	6	17419	17424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019048	TCGTG	2	10	17428	17437	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_019048	CAT	2	6	17487	17492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_019048	TAA	2	6	17522	17527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_019048	GGA	2	6	17531	17536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019048	ATC	2	6	17555	17560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019048	AC	3	6	17582	17587	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_019048	TGGT	2	8	17597	17604	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019048	CGC	2	6	17721	17726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_019048	AC	3	6	17751	17756	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_019048	CAC	2	6	17766	17771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_019048	AGCC	2	8	17814	17821	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_019048	GAT	2	6	17837	17842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019048	CCT	2	6	17893	17898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_019048	TAAGGA	2	12	17902	17913	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019048	AGG	2	6	17995	18000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019048	TAA	2	6	18176	18181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019048	GTTAA	2	10	18183	18192	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019048	GAA	2	6	18229	18234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019048	ACG	2	6	18246	18251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019048	GTAA	2	8	18269	18276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019048	GAAG	2	8	18351	18358	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019048	TAG	2	6	18417	18422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019048	GCGA	2	8	18425	18432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_019048	AGG	2	6	18439	18444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019048	AGA	2	6	18504	18509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019048	AG	3	6	18532	18537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019048	TCG	2	6	18608	18613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_019048	GGA	2	6	18621	18626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019048	CT	3	6	18647	18652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019048	GGGAG	2	10	18702	18711	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019048	ACA	2	6	18739	18744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_019048	ATG	2	6	18806	18811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019048	TGT	2	6	18876	18881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019048	GGA	2	6	18939	18944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019048	TC	3	6	19025	19030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_019048	ACC	2	6	19204	19209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_019048	AT	3	6	19225	19230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019048	AGC	2	6	19284	19289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_019048	ATTC	2	8	19291	19298	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_019048	TG	3	6	19415	19420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019048	AAG	2	6	19421	19426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_019048	GAG	2	6	19436	19441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_019048	GA	3	6	19566	19571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019048	ACA	2	6	19592	19597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019048	TA	3	6	19620	19625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019048	CTAA	2	8	19647	19654	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_019048	GAG	2	6	19736	19741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019048	TAG	2	6	19749	19754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019048	GA	3	6	19861	19866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019048	CT	3	6	19977	19982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_019048	GAT	2	6	19995	20000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019048	CGG	2	6	20086	20091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_019048	GA	3	6	20184	20189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019048	TAGG	2	8	20302	20309	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019048	GTT	2	6	20346	20351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019048	TAC	2	6	20356	20361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_019048	CCT	2	6	20444	20449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_019048	GGT	2	6	20580	20585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019048	TCG	2	6	20695	20700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_019048	CGT	2	6	20775	20780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_019048	AGGGA	2	10	20913	20922	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019048	GA	3	6	20999	21004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_019048	AGT	2	6	21231	21236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019048	TAG	2	6	21593	21598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019048	CGT	2	6	21769	21774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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